16 Dec 2012

The so called Vacation period

Vacation period. Such a fun term, in academia it might be a very extended period (if you're a teacher of course) or a very short period of time, and not so restful (if you're a grad student). These holidays I expect to have published a paper in order to earn my vacations. And even in my "vacations" I'm gonna work very hard since I've been having lots of fun the whole year :-)
And you guys? How about you?
Is there going to be a "vacation period"

10 Oct 2012

Su nombre es ... o la chaqueta mental de un individuo socialmente incompetente.

Comencemos este post poniendo de manifiesto que no me gusta el aguacate, no me desagrada, puedo comerlo, de hecho en la combinacion necesaria creo que puede no ser tan malo, por ejemplo si le agregan algo de jitomate y cebolla, un poco que chile de arbol en pequenas rodajas y mucho limon, puede quedar un complemento para sus tacos muy pero muy rico. Como funciona este ejemplo para explicar el titulo de este post? Simple: aunque a mi el aguacate no me guste, el aguacate sencillamente no hace ningun tipo de drama por ello.
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Luego entonces lo siguiente, siendo socialmente incompetente la verdad que las relaciones humanas no son ciertamente mi especialidad, aquellos que me conozcan sabran que sin ser desagradable en realidad entablar una platica con alguien no es necesariamente facil. Por ello, la chaqueta mental entra (entró) en juego de una forma muy particular fastidiando muchos de mis pensamientos/sentimientos desde el mes de Abril.
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Comenzando por la parte en donde la conoci, una muchachita muy simpatica, muy linda (a mi parecer, y tambien al de otros tantos), sin duda inteligente y con un aura muy agradable. Yo, soltero, sin compromisos y con ganas de iniciar algo, me lanzo al ruedo y sutilmente la invito a salir, acepta y comienza la odisea.
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Sin duda un click instantaneo, una de las (tantas) platicas mas amenas y naturales que he tenido jamas, so, comence a caer, y cai durisimo. Para mi ya no era solo esa chica, era la chica con la que podia estar HORAS platicando, sin aburrirme, sin sentir ganas de asesinar a alguien, sin distraerme, concentrandome en sus ojos y en sus labios (delgaditos delgaditos). Final de cuentas y para no hacer un post larguisimo, tuve tres strikes, el primero cuando ella notó que yo mostraba intenciones hacia ella, segundo strike cuando no me di por vencido y ademas descubri que ella y yo teniamos mas en comun de lo que pensabamos, tercer strike, cuando quise llevar las cosas con mucha calma, sin quitar el dedo del renglon. En palabras de Robin Scherbatsky de How I met your mother: "Chemistry. If you have chemistry, you only need one other thing. Timing, but timing is a bitch".
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En efecto (o al menos eso quisiera creer), me tope con la chica ideal en el momento menos adecuado. A dos meses del ultimo strike sigo con ella en cada pensamiento, y los sueños que he tenido acerca de ella, no ayudan en absolutamente nada. Sin embargo, como en algun momento mencionaba, soy cinta negra en reprimir mis sentimientos, asi que nuevamente tengo una "amiga nada mas", sin duda es una muy buena amiga.
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Sin embargo, el que solo sea mi amiga, habla de que soy conformista (por llamarlo de alguna manera), que al resignarme a quedarme con la duda de "y que habria pasado si..." este siendo un no-buen-cientifico, y que quiza este perdiendo una magnifica oportunidad (50/50, tambien puede ser que hubiesemos terminado odiandonos). En fin, todo esto ultimo es irreal y solo son las chaquetas mentales de un tipo con mucho tiempo para pensar las cosas... quiza demasiado tiempo. En fin (volviendo al aguacate), en todos los aspectos ella sale perfectamente bien librada, sencillamente no le gusto y punto, pese a que puedo ofrecer mucho. Deberia sentirme mal? Por su puesto que no, el aguacate no se siente mal de que yo prefiera otras frutas (si, el aguacate es una fruta). Por que deberia yo sentirme mal por no gustarle a alguien?
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Nuevamente por las chaquetas mentales, si no tuviera suficiente seso para (ademas de mis labores academicas), pensar en todo eso que pudo haber pasado, pensar en lo bien que podriamos estar juntos, etc, seguramente nada de esto estaria plasmado en este humilde blog. En fin, nada puede hacerse ya. Y si, seguro recibire (si es que alguien lee este blog) respuestas tipo: "Todo pasa por algo", "Ya llegara la adecuada", "Es solo cuestion de tiempo", sin embargo queridos, con la unica frase con la que estoy de acuerdo es con la primera.
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Como diria Jarvis de la banda Pulp en la cancion Happy endings: "And do you think that it's so easy to find somebody who is just your kind?", con respecto de la segunda frase. Con respecto de la tercera frase... no lo se, quiza si es cuestion de tiempo, pero como diria Robin: "Timing is a bitch".
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Hoy la vi, como siempre hermosa, y entro en accion mi super poder de reprimir sentimientos, tambien entro de forma nostalgica la idea de ser-solo-su-amigo, y mande lejos muy lejos la inquietud de saber que podria pasar en una realidad alterna.
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Maldiciones de un tipo suficientemente inteligente para pensar las cosas por duplicado y triplicado, y de un tipo suficientemente tonto para no darse cuenta de que el camino elegido no fue el correcto. En fin, solo necesitaba vaciar esto en un escrito, ya que hoy no pude hablarlo con ninguno de mis amigos. Mientras tanto seguire (comenzare?) con una presentacion para una platica de Genomica que dare el dia jueves 11 de octubre en la Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnologia. Buenas noches y gracias por su lectura.

7 Oct 2012

La famosa Xiuhcoatl y el desconocimiento general del computo

La computadora, ese bendito aparato que en muchas areas se ha convertido en una caja negra.
Que hace? No muchos lo saben.
Como lo hace? Muchos menos lo saben
Entonces que es Xiuhcoatl, que hace, como lo hace y para que nos sirve? Las respuestas son simples:
Que es? Es una computadora enorme, la mas poderosa del pais, la segunda mas poderosa de america latina.
Que hace? La pregunta real deberia ser "Que no hace"
Como lo hace? Con su maravillosa arquitectura: por principio de cuentas tiene procesadores intel, AMD y GPUs NVIDIA, segundo, la instalacion de cableado y la estructura de comunicacion entre clusters, tercero, la utilizacion de un sistema operativo Linux, cuarto, la presencia de muchos compiladores que permiten construir programas desde scratch, acoplando desde el programa mas sencillo hasta el mas complejo en la arquitectura antes mencionada, quinto (ultimo pero no por ello menos importante), el personal de apoyo que no solamente estuvo a cargo de la construccion del cluster, sino que tambien tiene conocimiento vasto acerca de lo que ocurre dentro del cluster, y como si eso no bastara, instruye a los usuarios externos para utilizar este clustersote.
Para que sirve? Sirve para lo que uno quiere que sirva, aqui es donde entra la principal polemica acerca del uso del cluster. Quien la puede ocupar? Que haria un usuario comun y corriente con una computadora de este calibre? Si ustedes piensan en un quimico teorico, en un fisico teorico o en un matematico, la solucion es simple, usan la maquina para hacer miles de millones de simulaciones que despues de un filtrado, tratamiento estadistico y posterior analisis, devendran en un resultado que a la humanidad le interese saber. Estructuras moleculares, dinamica de particulas, campos magneticos, series de numeros que antes uno solo podia imaginar. Pero y el area biologica? Lamentablemente aqui no hay grises, o es blanco o negro, o sabes bioinformatica en serio (no biologia computacional) y por ende puedes usar el cluster, o no sabes bioinformatica y no deberias usar el cluster. Aqui una ramificacion mas: Por que la gente en el area biologica no sabe bioinformatica, quiza pasa lo mismo que con el RNA o las Proteinas, el trabajo con este tipo de moleculas esta lleno de mitos, "Que si no le rezas a sabra dios que santo, se te degrada tu RNA", "Que si no orientas tu camara hacia la meca, tu gel no correra", "Que no debes ni de mirar tu muestra porque se contamina", etc, y hasta que no trabajas con estas moleculas es que te das cuenta que muchos de los mitos son solo eso, mitos. Volviendo a la bioinformatica, ocurre exactamente lo mismo, hasta que no le das la oportunidad a una terminal de demostrarte que en realidad es sencillo, nunca perderas el miedo a trabajar bioinformatica. En efecto cualquiera puede teclear NCBI BLAST en google, hacer una busqueda (no analisis) y obtener un resultado, pero tambien cualquiera puede escribir unas lineas de codigo y automatizar un proceso, o mejorarlo, o revolucionarlo. En fin, estamos acostumbrados a escribir, y mucho de la bioinformatica radica en ello, escribir, escribir y escribir. Por que no lo hacemos? Quiza porque de entrada no dominamos del todo nuestro propio idioma (basta ver este blog sin un condenado acento), luego, nos ensenan que el siguiente lenguaje que debemos aprender es el Ingles o Frances o Aleman o Ruso o Chino, dependiendo si piensas publicar, o escribir, o meterte en la tecnologia, o abrirte al conocimiento oculto (por no decir "ser cientifico hipster"), o darle a los negocios, respectivamente. Con todo lo anterior, BaSH, Perl, AWK, Java, C, C++, PHP, ruby, quedan como aquellos lenguajes que aunque estan en continuo desarrollo, nosotros ni por enterados. El mensaje global despues de tanta palabreria es el siguiente: "Si no tienen miedo de aprender otro idioma (Ingles, Frances, Aleman, Ruso, Chino), no teman entrarle al mundo de la programacion, se trata de linguistica, si bien los idiomas mencionados anteriormente te abren muchas puertas, los lenguajes computacionales te abren otras tantas, y al ser idiomas, requieren de los mismos cuidados, practicas, pero ante todo, no hay que temerles, y de igual manera, no sirve de nada saber cierto idioma, si no se practica y si no se aplica a lo que uno hace"
Piensenlo, la verdad la programacion es mucho menos fria de lo que muchos creen, pone a prueba tu inteligencia, creatividad, simplicidad y hasta la estetica.

23 Jan 2012

De los acentos y otros menesteres

-->Hace algun tiempo, unos 23 anios, comence a leer y a escribir.
-->Mi mente siempre ha estado renuente a seguir las reglas en el lenguaje (por lo menos en espaniol), de forma que siempre he tenido problemas con la acentuacion de las palabras, y en parte, es por ello que no me gusta mucho el idioma espaniol.
-->Hasta hace unos momentos creia que los acentos eran innecesarios, sin embargo ahora, creo que son... bueno, sigo creyendo que son innecesarios.
-->Normalmente casi todas las palabras en el espaniol pueden entenderse a traves del contexto, no es necesario ponerle acento a (todas) las palabras en una oracion, basta con leer la palabra anterior y la siguiente a la palabra conflictiva para saber la entonacion adecuada y el significado de la misma (se acentue o no).
-->Sin embargo hay palabras que pueden prestarse a confusiones, pese al contexto.
-->Por ejemplo, hoy puse un post en Facebook, decia asi:
"Dime que soy para ti"
-->Mis amigos y conocidos entendieron lo siguiente:
"Dime lo que yo soy para ti"
-->Yo no queria decir eso, en realidad queria decir:
"Dime que yo soy para ti".
-->Llegue a la conclusion de que el espaniol es como la celula eucariotica de divergencia temprana:
-->Con tal de minimizar el uso de recursos -genes en el caso de la celula, palabras en el caso de la lengua-, se recurre a la elaboracion de construcciones contexto-dependientes con variaciones minimas pero significativas para obtener el maximo numero de combinaciones posibles -variantes de splicing alternativo en el caso de la celula, acentos en el caso de la lengua-
-->Tambien llegue a la conclusion de que el lenguaje podria ser como la celula procariotica, es decir, un recurso para cada necesidad. Y adivinen que? El ingles es masomenos asi, y me gusta mas que el espaniol.
-->Retomando el ejemplo anterior, mi post, en ingles se habria leido asi:
"Tell me that I am for you"
-->Y no habria habido confusion porque para obtener el mensaje que mis amigos y conocidos entendieron, habria tenido que escribir:
"Tell me what I am for you"
-->Es decir, un mensaje diferente en cada caso, sin confusion, sin complicacion.
-->Hay quien dice que el espaniol es muy bonito, y estoy de acuerdo, pueden escribirse composiciones muy bonitas con toda la diversidad de palabras del idioma, sin embargo los elementos mas simples, son tan innecesariamente versatiles, que no solamente dejan de ser contexto-dependiente, sino que tambien ironicamente se vuelven complejos.
-->Hace como 400 anios, la "h" no se usaban en el idioma espaniol, hoy la usamos de forma muy comoda -haciendo composiciones complejas- no me sorprenderia que en 400 anios tengamos mas acentos que los franceses.
-->Volviendo a la comparacion de idiomas, el ingles, tan simple como es, sigue siendo un idioma muy bonito, puede sin problema hacerse un poema, una novela, un cuento y casi cualquier composicion tan linda como en espaniol -O frances, italiano, aleman, latin, griego, cualquier idioma-
-->Siendo parsimoniosos, la eleccion es sencilla, un idioma simple es un idioma facil, un idioma simple es un idioma bello.
-->Ahora que si lo que quieren es demostrar sus capacidades, escojan el espaniol, es un idioma que quien lo habla bien, es una persona muy pero muy capaz, la verdad, no cualquiera.
-->Tiene alguna finalidad este post? Quiza solo el puntualizar que hay idiomas mas simples -y no por ello menos bellos- que el espaniol, y que el uso de acentos esta algo sobrevalorado -en mi humilde opinion-
-->Comenten, la diversidad de opiniones es lo que hace rico a un blog. Asi como la diversidad de palabras hace rico a un idioma.

20 Jan 2012

San Juditas

Reflexion (nada nueva) acerca de San Judas Tadeo.

***Ideas antes de echar a correr la ardilla***
1.- Una muestra puede o no representar un universo
2.- Una prueba de asociacion esta directamente influenciada por el numero de elementos evaluados
***Sigamos***

La reflexion dice asi:

Vas en el microbus, kombi, autobus, incluso en el metro y los que viven en el estado de mexico, en el mexibus. Traes un smartphone -porque ahora con los creditos y con lo relativamente baratos que son, casi cualquiera trae uno-, traes un iPod -idem-, y si eres estudiante o freelancer o ejecutivo pobre (creanme, los hay), seguro tambien traes una laptop, no dejemos fuera las tablets, y en el caso de las chicas, ademas de lo anterior sumenle joyeria, accesorios, relojes y hasta la misma ropa.
Vas nada fancy, nada pretencios@, leyendo un libro, oyendo musica, disfrutando uno de los pocos ratos que tienes para ti.

Y de repente ocurre.

Se trepa un tipo que desde que esta en la calle lo identificas, no viene a compartir asiento contigo, quiere dinero y lo quiere facil. Lo minimo que hara es sacar un rollo que ya conoces, te manipula diciendote que prefiere pedir honrada y respetuosamente una moneda antes que robar. Lo cual se traduce en "Si no quieres que robe, dame dinero!" y gradualmente lo hacen cada vez menos amable. Esto ocurre una vez, y otra, y otra, y otra. Y vas viendo un patron cada vez mas comun. Ves los colores verde y amarillo en tu asaltante, comienzas a ver que la linea de playeras blancas con una imagen religiosa esta bien de moda, notas que lo in es traer un tatuaje que hace juego con tu playera.

Pregunta: Que tienen en comun tus asaltantes sea cual sea tu ruta? 
Respuesta: El elemento comun es un santo llamado San Judas Tadeo.

Pero... Y quien es este individuo tan popular?

San Judas Tadeo : Uno de los apostoles de Jesus, usualmente referido como Tadeo o Lebeo. El santo patrono de los casos dificiles y desesperados en la religion catolica. Inicialmente sus followers son, como bien dice su titulo, gente con algun caso dificil o desesperado. Actualmente sus followers siguen siendo gente con casos dificiles o desesperados, aunque con un marcado gusto por el reggaeton.

Luego pones en marcha la ardilla, piensas acerca de tus meticulosas observaciones y llegas a una pregunta fundamental (por lo menos para esta reflexion):

Sera correcto asociar el uso de imagenes de San Judas con el riesgo de ser asaltados?

Probablemente no.

Moralmente es incorrecto juzgar un libro por su portada -frase trillada que prometo no volver a usar- y asumir que si trae imagenes de san judas, te asaltara.

Peeeeero...

Estadisticamente es correcto (por lo menos de un lado de la grafica). La probabilidad asociativa de que te asalte si el individuo trae imagenes de San Judas, no es baja.

Y aqui es donde entra un factor bien importante. Nuestro universo de followers de san Judas esta siendo representado por los peores de su clase y por extension, eso significa que no todos los followers del susodicho deban ser malas personas y que quieran dinero facil al treparse al transporte publico.

Cual seria la actitud correcta al encontrarte a un follower de San Judas? La verdad no lo se, aunqe francamente prefiero guardar mis cosas antes de averiguarlo.

Entretanto dejare de usar el transporte publico un tiempo, ya tuve suficiente de los dichosos followers y aprecio mi iPod, mi laptop, mi wave y principalmente mi integridad fisica.

Opiniones? Francamente encontradas, mi madre es fiel seguidora y adoradora de San Judas pero no le gusta el reggaeton y mucho menos se trepa al transporte publico a conseguir dinero facil.

Conclusiones: Es dificil asumir una postura moralmente correcta cuando la evidencia numerica te advierte que un grupo de personas es potencialmente peligroso.

Nota aclaratoria: No tengo nada en contra de los reggaetoneros, ni de los devotos de San Judas, solo pongo en este blog la evidencia que he acumulado en muchos anios de usar el transporte publico. Asi que si hay un reggaetonero o un devoto de San Judas, no se me vayan a enojar, el punto de este post, es demostrar que no todos los reggaetoneros son peligrosos ni te van a asaltar. Aunque no es algo que muchos quisieran comprobar.

8 Dec 2011

De politicos que no leen y de sus hijas


Preguntas derivadas de un par de reflecciones


-> Quiza es mucho darle importancia a lo de Enrique Pena Nieto, y
   al respecto me planteo unas cuestiones a manera de
   reflecciones:


-> Las figuras publicas deben casi por default tener dos
   personalidades, una ante las camaras y una ante si mismos. Lo
   deseable es que no difieran mucho uno de la otra, de manera 
   que haya congruencia en las figuras que aparecen en los
   medios, representando cada uno su ramo (politica, ciencia,
   educacion, farandula).


-> Lo siguiente en mente es la replica de EPN ante la inminencia
   de la ahora (doblemente) indignada poblacion mexicana.


---> Que diria este hombre ante los medios con respecto de su
     fail en la FILGdl?


---> Que diria este hombre ante los medios con respecto de la
     respuesta de su malcriada hija?


-> La personalidad 1, quiza saldria con una respuesta diplomatica
   algo estirada y educada al respecto.
   Todos contentos.


-> Pero... que diria la personalidad 2. Aquella que no le rinde
   cuentas a nadie mas que a si mismo. Una persona consciente
   normalmente diria "Wey, esto que paso esta dos tres grave,
   mejor le echo ganas y pues me aplico, ya vere como salgo de
   esta y pues ni pedo, a ver que sale". Lo realmente intrigante,
   es que no sabemos que tan consciente es este hombre. Y
   finalmente quedan las siguientes preguntas (derivadas de la
   refleccion anterior):


---> Que tanto le afectara a nivel personal el fail y la replica
     de la hija?


---- Es decir, que tanto sera una llamada de atencion a mejorar
     como persona (para ambos)


---> Que tanto ira mas alla de la influencia a su campana
     politica.


---- Idem.




=> Think about it. It wont take long :) <=

26 Nov 2011

De placeres culposos y el lado oscuro de la vida

Ya hasta suena trillado hablar de los placeres culposos. Todo mundo tenemos uno de cada categoria: musica, TV, libros, comida, websites, y hasta de personas.
Esta no se trata de una entrada mas describiendo el porque de los placeres culposos ni pretende descubrir el hilo negro. Es quiza una de tantas publicaciones al respecto. O no?
De entrada casi todo placer tiene cierta culpa detras de si. Si no la hubiera no podriamos llamarlo placer, simplemente seria una comida, cancion, libro, actividad neutral. Luego entonces, el placer culposo es aquel que trae mas culpa que el resto de los placeres. Por ejemplo, chutarse una cancion de "La oreja de van Gogh" (recuerdese que escucho principalmente heavy metal). Que diferencia haria si fuera una power ballad? No mucho, no hay culpa. Pero la oreja... para empezar el nombre no tiene sentido (pero es una banda espanola, asi que eso es casi por default), luego la cancion -Cuidate-, la letra -Detras del tiempo me instale (WTF?!?!?!)-. Que tiene de placentero? Pues la rola esta linda, la voz no es mala (aunque no esta trabajada), esta alegre (+/-)... termina. Que tiene de culposo? Bueno, ya lo dije antes. Pero de vuelta, no hay placer sin culpa. Asi que entonces por definicion (recuerdese que tambien soy esencialmente un robot (segun mi hno que por definicion tambien deberia ser un robot)), cuanto mas culpa hay en un placer, mas placer hay en la actividad. Pero pues no. Uno oye "Cuidate" de la oreja, una vez y ya, una sonrisita, un suspiro quiza y hasta ahi, si hubiera tanto placer (porque lleva mas culpa), se nos haria vicio y pues no es asi. Luego entonces volteando las premisas, si no hay tanto placer, no hay tanta culpa, y si no hay tanta culpa no es placer culposo...
Intrincado. Esto lo unico que demuestra es que la definicion del placer culposo no es logica, cae facilmente en una paradoja de ida y vuelta.